（1）荒漠生态系统生物多样性及保护

物种多样性调查；生物适应机制研究；群落生态学研究；恢复生态学研究；保护管理策略研究。

（2）荒漠陆表生态环境监测与数字模拟

土地覆被监测；植被监测；土壤湿度监测；地表温度监测；数字模拟和模型建立；生态环境评估与管理。

（3）荒漠生态系统过程与调控

生态系统结构和功能；水文过程研究；土壤生态学研究；植被恢复与调控；生态系统服务功能评估。

（4）荒漠监测、生态修复与实践

监测技术与方法；荒漠生态修复技术；植被恢复与种质资源研究；生态修复效果评价；社会参与政策支持。